研究报告

棉花四个C2H2锌指蛋白基因的克隆与表达分析  

周垚均 , 任艳萍 , 代培红 , 刘超 , 刘晓东 , 李月*
新疆农业大学农学院, 乌鲁木齐, 830001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2021年01月22日    接受日期: 2021年01月29日    发表日期: 2021年07月25日
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摘要

水稻广谱抗病基因 Bsr-d1 编码 C2H2 型锌指蛋白,本研究基于此通过 RT-PCR 技术从棉花中克隆4 个与水稻 Bsr-d1 同源的 C2H2 型锌指蛋白基因并对其进行了生物信息学分析和表达分析,结果表明这些基因氨基酸序列与 Bsr-d1 的一致性为 25%~35.7%,故命名为 GhBsr-d1L1~GhBsr-d1L4GhBsr-d1Ls 基因的开放阅读框大小为 663~813 bp,编码的氨基酸数为 220~270,蛋白质分子量为 23.82~28.64 kD,理论等电点为7.22~8.56,不稳系数为 47.7~67.17,亲水平均数为 -0.755~ -0.544,无信号肽和跨膜结构域;GhBsr-d1Ls 均定位于细胞核,编码 N 端的保守 L-box 结构域,C2H2 型锌指结构域以及 C 端的转录抑制结构域 EAR/DLN-box,属于陆地棉中第C2H2 型锌指蛋白亚家族。系统发育树分析表明,GhBsr-d1L1 GhBsr-d3L3 的遗传距离最近,GhBsr-d1L2 与大豆 SCOF-1 遗传距离最近,GhBsr-d1L4 与长果种黄麻的同源基因遗传距离最近。荧光定量 PCR 分析表明,GhBsr-d1Ls 基因在根、下胚轴及真叶中均表达,但表达量各有差异,同时在不同程度上 GhBsr-d1Ls 均受到大丽轮枝菌的诱导。推测 GhBsr-d1Ls 基因可能在棉花响应大丽轮枝菌时起重要作用。
 

关键词
棉花;Bsr-d1;C2H2 锌指蛋白;基因克隆;表达分析

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《分子植物育种》印刷版
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